RESUMO Visando auxiliar o melhorista na escolha da melhor metodologia para análises de diversidade genética em populações de retrocruzamento avaliaram-se os métodos baseados em informações fenotípicas. Os fenótipos foram simulados para 13 características, geradas em 10 populações com 100 indivíduos cada. Geraram-se informações genotípicas de 100 locos, dos quais 20 foram tomados ao acaso para determinar as características, manifestando dois alelos. Medidas de dissimilaridade foram calculadas, e analisou-se a diversidade genética por meio agrupamento hierárquico e projeção gráfica das distâncias. A partir das duas populações mais divergentes fez-se o retrocruzamento. Considerou-se um conjunto de características com herdabilidade variável. Simulou-se o efeito ambiental admitindo distribuição normal, com média zero e variância σ2. Para as análises de agrupamentos hierárquicos utilizaram-se os métodos: Método de Gower, Ligação média dentro de grupo, Ligação média entre grupo, Vizinho mais distante, Vizinho mais próximo, Método de Ward, Método da mediana. O efeito ambiental e a herdabilidade das variáveis analisadas influenciaram o padrão de agrupamento de populações sob retrocruzamento. Em características de herdabilidade elevada, o método do Vizinho mais próximo foi o mais eficiente em reconstituir o retrocruzamento, além de ter apresentado a maior correlação cofenética, sendo considerada a melhor metodologia a priori e a posteriori.

ABSTRACT Methods to obtain phenotypic information were evaluated to help breeders choosing the best methodology for analysis of genetic diversity in backcross populations. Phenotypes were simulated for 13 characteristics generated in 10 populations with 100 individuals each. Genotypic information was generated from 100 loci of which 20 were taken at random to determine the characteristics expressing two alleles. Dissimilarity measures were calculated, and genetic diversity was analyzed through hierarchical clustering and graphic projection of the distances. A backcross was performed from the two most divergent populations. A set of characteristics with variable heritability was taken into account. The environmental effect was simulated assuming x~N(0, σ2). For hierarchical clusters, the following methods were used: Gower Method, average linkage within the cluster, average linkage among clusters, the furthest neighbor method, the nearest neighbor method, Ward's method, and the median method. The environmental effect and heritability of the analyzed variables had an influence on the pattern of hierarchical clustering populations according to the backcrossed generations. The nearest neighbor method was the most efficient in reconstructing the system of backcrossing, and it presented the highest cophenetic correlation. The efficiency of the nearest neighbor method was the highest when the analysis involved characteristics of high heritability.

O objetivo deste trabalho foi verificar a presença de interação genótipo x ambiente (G x A) e determinar a adaptabilidade e estabilidade fenotípica de linhagens de algodão de fibra marrom, utilizando o modelo de Ebehart & Russell. Foram conduzidos sete experimentos nos estados de CE, GO, MS e RN, em 2010 e 2011, em regime irrigado e de sequeiro. O delineamento utilizado foi blocos casualizados com quatro repetições. Foram avaliados 11 genótipos, segundo sete caracteres relativos à fibra. A interação G x A foi significativa para a maioria dos caracteres. As linhagens 1, 2, 3, 4, 5 e 7 demonstraram capacidade de resposta à melhoria de ambiente, sendo 1 e 5 os genótipos que apresentaram comportamento previsível para todas as características. O índice de fibras curtas mostrou ser uma característica de alta previsibilidade

The objective of this study was to verify the presence of genotype x environment (G x E) interaction and determine the adaptability and phenotypic stability of strains of brown cotton fiber using the model of Ebehart & Russell. Seven experiments were conducted in the states of CE, GO, MS and RN, in 2010 and 2011 under irrigated and rain fed conditions. The experimental design was randomized blocks with four replications. Eleven genotypes were assessed according to seven characters on the fiber. The G x E interaction was significant for most characters. The lines 1, 2, 3, 4, 5 and 7 showed better responsiveness to the environment, being 1 and 5 genotypes showed all predictable behavior characteristics for all characteristics. The content of short fibers proved to be a characteristic of high predictability

The purpose of this work was to evaluate a methodology of adaptability and phenotypic stability of alfalfa genotypes based on the training of an artificial neural network considering the methodology of Eberhart and Russell. Data from an experiment on dry matter production of 92 alfalfa genotypes (Medicago sativa L.) were used. The experimental design constituted of randomized blocks, with two repetitions. The genotypes were submitted to 20 cuttings, in the growing season of November 2004 to June 2006. Each cutting was considered an environment. The artificial neural network was able to satisfactorily classify the genotypes. In addition, the analysis presented high agreement rates, compared with the results obtained by the methodology of Eberhart and Russell.

O objetivo deste trabalho foi estimar o ganho genético em pinhão-manso (Jatropha curcas) com uso de diferentes índices de seleção e estabelecer a melhor estratégia de seleção para a espécie. A seleção direta e indireta foi realizada com diferentes índices de seleção, o que totalizou 14 estratégias. Foram analisadas 175 famílias pertencentes ao banco ativo de germoplasma da Embrapa Agroenergia, em blocos ao acaso, com duas repetições. Foram avaliadas as variáveis: produtividade de grãos; sementes por fruto; razão endosperma/semente; peso, comprimento, largura e espessura de sementes; número de ramos a 0,5, 1,0 e 1,5 m; altura de plantas; diâmetro do caule; projeção da copa nas linhas e nas entrelinhas; volume da copa; juvenilidade (dias até o florescimento); e altura de inserção da primeira inflorescência. As avaliações foram realizadas durante o segundo ano de cultivo. A utilização de índices de seleção é relevante para maximizar os ganhos genéticos em pinhão-manso e favorece uma melhor distribuição de características desejáveis. Os índices multiplicativos e restritivos são considerados os mais promissores para uso na seleção.

The objective of this work was to estimate genetic gains in physic nut (Jatropha curcas) using selection indexes and to establish the best selection strategy for the species. Direct and indirect selection was carried out using different selection indexes, totalizing 14 strategies. One hundred and seventy five families from the active germplasm bank of Embrapa Agroenergy, Brasília, Brazil, were analyzed in a randomized complete block design with two replicates. The evaluated traits were: grain yield; seeds per fruit; endosperm/seed ratio; seed weight, length, width, and thickness; branches per plant at 0.5, 1.0, and 1.5 m; plant height; stem diameter; canopy projection on rows and between lines; canopy volume; juvenility (days to the first flowering); and height of the first inflorescence. Evaluations were done during the second year of cultivation. The use of selection indexes is relevant to maximize the genetic gains in physic nut, favoring a better distribution of desirable traits. The multiplicative and restrictive indexes are considered the most promising for selection.

O objetivo deste trabalho foi desenvolver um processo de integração de mapas genéticos, com o uso do inverso da variância, e testar sua eficiência. Foram utilizadas populações simuladas F2 codominante e de retrocruzamento, com tamanhos populacionais de 100, 150, 200 e 400 indivíduos, tendo-se considerado uma espécie diploide fictícia com 2n = 2x = 2 cromossomos, com o comprimento total do genoma por grupo de ligação estipulado em 100 cM, 21 marcas por grupo de ligação e marcadores equidistantes em 5 cM. Os genomas foram comparados quanto ao tamanho do grupo de ligação, variância das distâncias entre marcas adjacentes, correlação de Spearman e quanto ao estresse relativo à adequação das distâncias estimadas. Cada genoma simulado foi fragmentado em quatro novos mapas: três com oito marcadores e um com nove marcadores, cada qual com quatro marcadores âncoras. Os mapas foram alinhados, ordenados, integrados e, em seguida, comparados ao mapa de origem. O processo de integração de mapas proposto mostrou-se eficiente. Os mapas gerados tiveram pequena tensão interna em comparação aos mapas dos quais se originaram. A integração de mapas depende do tipo de população utilizada, tamanho da população, tipo de marcador, da frequência de recombinação e da fase de ligação.

The objective of this work was to develop an integration process of genetic maps using the inverse variance, and to test its efficiency. Simulated F2 codominant populations and backcrosses of 100, 150, 200, and 400 plants were used, considering a virtual diploid species with 2n = 2x = 2 chromosomes, with total genome length per linkage group estipulated in 100 cM, 21 marks per linkage group, and equidistant markers spaced at 5 cM. The genomes were compared for linkage group size, distance variance between adjacent marks, Spearman correlation and stress related to the estimated distances adequation. Each simulated genome was fragmented into four new maps: three with eight makers and one with nine, each containing four anchor markers. The maps were aligned, ordered, integrated and, then, compared with the original map. The proposed map integration process proved to be effective. The generated maps showed a little internal tension in comparison to the original ones. Map integration depends on the population type, population size, marker type, recombination frequency, and on the linkage phase.

This study aimed to evaluate the need for individual path analysis to Cherry (L. esculentum var. cerasiforme) and Salad (L. esculentum) tomatoes type, seeking information about which variables are associated with post-harvest resistance (PHR), and guide the selection of material for breeding programs. We performed the variance analysis, genotypic correlations, multicolinearity diagnosis, and the display of genotypic correlations through path analysis. The more explicatory variables of PHR in Salad tomatoes type were the peduncle scar diameter (PSD) and the fruit mean diameter (FMD); the mesocarp thickness (MST) and fruit mean weight (FMW) in cherry type. For Cherry tomatoes, gains can be obtained in the PHR through indirect selection by MST. This will be greatest if among the fruits with more MST are selected that with lower FMW. In the case of Salad, it must indirectly select the fruits with lower PSD and among these, the fruits with the most FMD. The path analysis should be done considering each type of tomato, since the explicatory variables differ between them.

Este trabalho objetivou avaliar a necessidade de realizar análise de trilha individualizada para tomates tipo Salada (L. esculentum) e Cereja (L. esculentum var. cerasiforme), visando obter informações sobre quais variáveis estão relacionadas com a resistência pós-colheita (RPC), e orientar a seleção de materiais para programas de melhoramento. Realizaram-se análises de variâncias, correlações genotípicas, diagnóstico de multicolinearidade e o desdobramento das correlações genotípicas por meio de análise de trilha. As variáveis mais explicativas da RPC em tomates tipo Salada foram o diâmetro da cicatriz do pedúnculo (DCP) e o diâmetro médio do fruto (DMF); a espessura do mesocarpo (ESP) e o peso médio dos frutos (PMF) em tipo Cereja. Em tomates Cereja, ganhos podem ser obtidos na RPC por meio de seleção indireta via ESP. Estes serão maiores se dentre os frutos de maior ESP forem selecionados os de menor PMF. No caso de Salada, deve-se selecionar indiretamente os frutos de menor DCP e dentre estes os de maior DMF. A análise de trilha deve ser realizada considerando cada tipo de tomate, visto que as variáveis explicativas diferem entre estes.

Solanum commersonii subsp. commersonii Dun. e Solanum commersonii subsp. malmeanum Bitt. (2n=2x=24 - 1EBN) não podem ser diretamente cruzadas com a batata cultivada de S. tuberosum subsp. tuberosum L. (2n=4x=48 -4 EBN) em razão da barreira da ploidia e do número de equilíbrio do endosperma (EBN). No entanto, a produção de pólen não reduzido por S. commersonii ssp. (2x=2n=24 - 1EBN), permite o cruzamento desta com dihaplóides de batata e com as espécies diplóides S. phureja Juz. & Bukasov. e S. chacoense Bitt., que possuem 2 EBN. Conduziu-se este trabalho, com o objetivo de determinar o mecanismo meiótico e a freqüência dos grãos de pólen não reduzidos em cinco clones de Solanum commersonii ssp. Foram avaliados três clones de S. commersonii subsp. commersonii (SCC) e dois de S. commersonii subsp. malmeanum (SCM). Nas avaliações, duzentos grãos de pólen viáveis foram corados (carmim acético 2%) e mensurados, sendo considerados não reduzidos aqueles com o diâmetro igual ou superior a 25 µm. O clone Solanum commersonii subsp. commersonii Dun. (SCC 100) produz 26.1% de polen não reduzido, por fusos fundidos e fusos paralelos, o qual pode ser utilizado em programas de melhoramento.

Solanum commersonii subsp. commersonii Dun. and Solanum commersonii subsp. malmeanum Bitt. (2n=2x=24 -1EBN) cannot be directly crossed with the cultivated Solanum tuberosum subsp. Tuberosum L. (2n=4x=48 - 4EBN) species due to ploidy barriers and endosperm balance number (EBN). However, non-reduced pollen production by the wild species S. commersonii ssp. (2x=2n=24 -1EBN), allows the crossing of these species with dihaploids of potato and with the diploids species, S. phureja Juz. & Bukasov. and S. chacoense Bitt., all with 2EBN. The aim of this work was to determine the meiotic mechanism and frequency of non-reduced pollen production of five clones of S. commersonii ssp. Three different clones of S. commersonii subsp. commersonii Dun. (SCC) and two of S. commersonii subsp. malmeanum Bitt. (SCM) were evaluated. In the evaluation, two hundred viable pollen grains were stained (2% acetic carmin) and measured. The pollen grains measuring 25 µm in diameter or more were considered nonreduced. The clone Solanum commersonii subsp. commersonii Dun. (SCC 100) produces 26.1% of non-reduced pollen grains caused by parallel spindles and fusion spindles, which may be used in breeding program.

O objetivo deste trabalho foi alterar o método centroide de avaliação da adaptabilidade e estabilidade fenotípica de genótipos, para deixá-lo com maior sentido biológico e melhorar aspectos quantitativos e qualitativos de sua análise. A alteração se deu pela adição de mais três ideótipos, definidos de acordo com valores médios dos genótipos nos ambientes. Foram utilizados dados provenientes de um experimento sobre produção de matéria seca de 92 genótipos de alfafa (Medicago sativa) realizado em blocos ao acaso, com duas repetições. Os genótipos foram submetidos a 20 cortes, no período de novembro de 2004 a junho de 2006. Cada corte foi considerado um ambiente. A inclusão dos ideótipos de maior sentido biológico (valores médios nos ambientes) resultou em uma dispersão gráfica em forma de uma seta voltada para a direita, na qual os genótipos mais produtivos ficaram próximos à ponta da seta. Com a alteração, apenas cinco genótipos foram classificados nas mesmas classes do método centroide original. A figura em forma de seta proporciona uma comparação direta dos genótipos, por meio da formação de um gradiente de produtividade. A alteração no método mantém a facilidade de interpretação dos resultados para a recomendação dos genótipos presente no método original e não permite duplicidade de interpretação dos resultados.

ABSTRACT The objective of this work was to modify the centroid method of evaluation of phenotypic adaptability and the phenotype stability of genotypes in order for the method to make greater biological sense and improve its quantitative and qualitative performance. The method was modified by means of the inclusion of three additional ideotypes defined in accordance with the genotypes' average yield in the environments tested. The alfalfa (Medicago sativa L.) forage yield of 92 genotypes was used. The trial had a randomized block design, with two replicates, and the data were used to test the method. The genotypes underwent 20 cuts, from November 2004 to June 2006. Each cut was considered an environment. The inclusion of ideotypes of greater biological average production in the environments produced an arrow-shaped graphical dispersion directed to the right in which the most productive genotypes were placed near the tip of the arrow. With the alteration only five genotypes were classified into the former classes of the original centroid method. The arrow-shaped figure allowed a direct comparison of genotypes throughout the productivity gradient. The alteration performed in the method preserved the easy interpretation of results for genotype recommendations of the original method, and does leaves no room for ambiguity in interpretation of the results.

O objetivo deste trabalho foi detectar diferenças entre duas espécies de pimenta-longa por meio de análise de cariótipos. Foram analisados cinco acessos de Piper hispidinervum (Piperaceae) C. DC. e Piper aduncum L. (Piperaceae) pertencentes à coleção de germoplasma da Embrapa Acre, utilizando-se o método de esmagamento e coloração de Feulgen. As duas espécies apresentaram número cromossômico 2n = 24 e cromossomos pequenos e metacêntricos com comprimento médio de 1,38 µm em P. hispidinervum e 1,32 µm em P. aduncum. Pelos descritores citogenéticos obtidos não há diferença entre as duas espécies.

The aim of this work was to detect differences between two species of long pepper by karyotypic analysis. Five acessions of Piper hispidinervum C. DC. (Piperaceae) and Piper aduncum L. (Piperaceae), belonging to germplasm collection of Embrapa Acre, were analysed using squashing technique and Feulgen staining. The chromosome number observed for both species was 2n = 24 and karyotype presented small metacentric chromossomes, with average length of 1.38 µm in P. hispidinervum and 1.32 µm in P. aduncum. Karyotypic descriptions pointed out that the species are not different.